Vrstva Natura 2000 je vytvářena jako součást služby evropského programu Copernicus pro monitorování území. Jedná se o výřez vrstvy na území ČR pro lepší zpřístupnění služby českým uživatelům. Vytvoření dat bylo financováno Evropskou unií.
Data vznikala poloautomatickou klasifikací družicových snímků s velmi vysokým prostorovým rozlišením s využitím dalších zdrojů (Corine Land Cover, Urban Atlas, Riparian Zones apod.). Výsledná vrstva byla oříznuta na území České republiky. Technické specifikace jsou k dispozici zde: http://land.copernicus.eu/user-corner/technical-library.